Hey Mike,
hmmmm... Ich gehe davon aus, dass Du die vorderen Scheiben getauscht hast, oder? In der Regel kommt so ein pulsierendes Bremspedal, ohne dass das ABS anspringt, bei höheren Geschwindigkeiten von vorn, hinten bremsen die Mercens IME eh nur so halblebig mit.
Ich tippe, wohl wissend dass Fern-Voodoo immer schwierig ist, auch wie Jürgen auf einen Seitenschlag/verzogene Scheibe. Hast Du die Bremse am Anfang heiß gefahren und das Auto mit einer knalleheißen Bremse abgestellt? Das kann schon reichen, dass sich die Scheiben verziehen, weil sie ungleichmäßig abkühlen. Der Belag klemmt ein wenig, und er hält die Wärme darunter auch länger.
Ich würde entweder das Rad abbauen, eine Messuhr anbauen (mit wieder montierten Radbolzen, damit die Scheibe plan auf dem Träger aufliegt) und dann mal den Seitenschlag prüfen (IIRC <2/10 mm) oder Du fährst auf einen Rollenbremsenprüfstand. Bei zartem Anlegen der Bremse müsstest Du dann sehen, ob der Zeiger schwankt.
Good luck und beste Grüße
Ph.